More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1256 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  58.71 
 
 		 672 aa  680    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  59.24 
 
 		 669 aa  715    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  68.01 
 
 		 692 aa  873    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  58.84 
 
 		 679 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  53.7 
 
 		 690 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  67.66 
 
 		 728 aa  819    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  100 
 
 		 696 aa  1362    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  51.71 
 
 		 681 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  52.5 
 
 		 685 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  52.91 
 
 		 765 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  51.65 
 
 		 673 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  50.78 
 
 		 706 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  52.78 
 
 		 674 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.34 
 
 		 694 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  51.05 
 
 		 684 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  50.21 
 
 		 699 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  52.11 
 
 		 699 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  53.09 
 
 		 665 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  53.09 
 
 		 665 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  53.09 
 
 		 665 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.39 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  54.36 
 
 		 676 aa  567  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  52.7 
 
 		 670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  51.14 
 
 		 706 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  51.72 
 
 		 664 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  48.12 
 
 		 664 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  50.71 
 
 		 677 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  51.84 
 
 		 676 aa  536  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  49.57 
 
 		 683 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  49.49 
 
 		 699 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  49.37 
 
 		 710 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.78 
 
 		 674 aa  327  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.64 
 
 		 636 aa  298  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  46.44 
 
 		 844 aa  296  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.99 
 
 		 725 aa  291  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  36.91 
 
 		 631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  33.57 
 
 		 725 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  35.42 
 
 		 643 aa  286  8e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  34.1 
 
 		 650 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.43 
 
 		 660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.95 
 
 		 650 aa  283  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.61 
 
 		 636 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.61 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  35.6 
 
 		 755 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.61 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.61 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.99 
 
 		 707 aa  282  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.61 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.61 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.61 
 
 		 636 aa  282  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.61 
 
 		 636 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.12 
 
 		 646 aa  281  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  34.4 
 
 		 647 aa  280  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  34.97 
 
 		 651 aa  280  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.09 
 
 		 640 aa  280  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  35.45 
 
 		 751 aa  280  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.47 
 
 		 636 aa  279  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  33.77 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.57 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  33.48 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  33.19 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  33.19 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  34.41 
 
 		 634 aa  274  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  33.19 
 
 		 636 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  33.19 
 
 		 636 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  33.72 
 
 		 639 aa  271  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  35.25 
 
 		 649 aa  271  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.73 
 
 		 641 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  34.48 
 
 		 757 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  34.76 
 
 		 755 aa  269  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  33.33 
 
 		 646 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.71 
 
 		 930 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  34.5 
 
 		 749 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.92 
 
 		 639 aa  266  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  30.45 
 
 		 647 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  34.76 
 
 		 668 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.34 
 
 		 645 aa  263  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.27 
 
 		 659 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  33.67 
 
 		 670 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  27.06 
 
 		 709 aa  262  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.84 
 
 		 652 aa  262  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.06 
 
 		 674 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.75 
 
 		 957 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.61 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.81 
 
 		 832 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  29.91 
 
 		 659 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  35.32 
 
 		 649 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  33.07 
 
 		 641 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  33.07 
 
 		 641 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  29.42 
 
 		 641 aa  261  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  32.44 
 
 		 658 aa  261  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  33.78 
 
 		 635 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  29.92 
 
 		 662 aa  261  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  30.45 
 
 		 641 aa  260  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.42 
 
 		 634 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.42 
 
 		 634 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.04 
 
 		 651 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  32.95 
 
 		 653 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  32.42 
 
 		 634 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.55 
 
 		 646 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>