More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0033 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  100 
 
 
301 aa  584  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  64.73 
 
 
304 aa  335  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  51.24 
 
 
286 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  50.89 
 
 
284 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  55.12 
 
 
288 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  51.59 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  54.04 
 
 
276 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  49.83 
 
 
297 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  51.97 
 
 
295 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  45.42 
 
 
311 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  57.94 
 
 
358 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  40.36 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  31.86 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  38.81 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  28.62 
 
 
288 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  36.84 
 
 
271 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  37.79 
 
 
305 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  34.83 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  37.14 
 
 
284 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  39.46 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.56 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  38.23 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  31.51 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  33.45 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  35.89 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  34.48 
 
 
287 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  34.36 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  28.96 
 
 
294 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.4 
 
 
288 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  32.17 
 
 
286 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  32.17 
 
 
286 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  34.24 
 
 
294 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  31.82 
 
 
286 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  31.47 
 
 
286 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  31.47 
 
 
286 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  31.47 
 
 
286 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  31.47 
 
 
286 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  32.03 
 
 
283 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  32.87 
 
 
283 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  34.02 
 
 
284 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
285 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  31.47 
 
 
286 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  28.52 
 
 
292 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  31.12 
 
 
286 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  31.4 
 
 
285 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  35.89 
 
 
280 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  31.74 
 
 
285 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  29.83 
 
 
584 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.52 
 
 
295 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  30.56 
 
 
298 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  31.03 
 
 
281 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  33.62 
 
 
285 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  31.4 
 
 
285 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  30.45 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  33.56 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  32.32 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  32.76 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  32.76 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  37.63 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  32.76 
 
 
282 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  29.11 
 
 
288 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  35.79 
 
 
290 aa  99  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  32.41 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  35.31 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  24.05 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  32.64 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  32.75 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  31.82 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  31.03 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  34.62 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  31.21 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  30.82 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.6 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  38.84 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  31.85 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  30.21 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  31.08 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  29.86 
 
 
273 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.27 
 
 
281 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  34.51 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  34.04 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  34.62 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.63 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.59 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.92 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  29.9 
 
 
285 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.1 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.56 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  37.81 
 
 
282 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  33.11 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  33.68 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  31.12 
 
 
274 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.22 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  33.45 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  34.02 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  33.8 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  30.72 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  40.65 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.28 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  31.29 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>