More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3195 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 374 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  37.59 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  30.25 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  31.69 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 367 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2910  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.659583  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.55 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  30.65 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  29.12 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 		 198 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  27.61 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 342 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 373 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  24.04 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 334 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 340 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0530  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.15 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 333 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  26.78 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  29.8 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0399  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  24.76 
 
 		 338 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  24.48 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 344 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 345 aa  86.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04000  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  29.78 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>