77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6226 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  65 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  50.55 
 
 		 184 aa  189  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  35.33 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  35.76 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 220 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.89 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.19 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.53 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 		 229 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  29.24 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.24 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  29.24 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  29.94 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  29.24 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.74 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.39 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  29.77 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.79 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  31.76 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.91 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.92 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  27.7 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.17 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  29.46 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  28.32 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  29.61 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  27.21 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.52 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  28.7 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.81 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  25.82 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  25.17 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.83 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.69 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.85 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  25 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  25.2 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  25.64 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  27.52 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.35 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 		 185 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  22.98 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>