More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1497 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 417 aa  850    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  89.69 
 
 		 417 aa  768    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  51.21 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.96 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 245 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 243 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 237 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  33.75 
 
 		 244 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 238 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 247 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 		 265 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 235 aa  98.6  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 239 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  32.03 
 
 		 256 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 237 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 		 233 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 232 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 244 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 279 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  26.91 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  27.04 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 		 257 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.19 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 264 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.54 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  25.89 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  28.82 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  31.61 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.03 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  29.33 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  28.38 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 		 268 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 237 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  36.63 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  28.79 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.63 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  28.32 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 247 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.96 
 
 		 269 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14599 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02393  short chain oxidoreductase/dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01770)  34.07 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.559669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 		 270 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 241 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 265 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 276 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 		 284 aa  67  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 291 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  29.2 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1582  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  23.53 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  28.71 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4606  hypothetical protein  43.42 
 
 		 109 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  36.46 
 
 		 141 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  26.38 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 287 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  31.19 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>