224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0576 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0576  Threonine aldolase  100 
 
 		 352 aa  707    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4454  L-threonine aldolase  77.93 
 
 		 370 aa  547  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3604  threonine aldolase  78.67 
 
 		 355 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.51138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3651  threonine aldolase  81.4 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  59.65 
 
 		 461 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  59.08 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0639  L-threonine aldolase  57.63 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  59.08 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  59.08 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  59.08 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  58.79 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  58.79 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  59.08 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  59.08 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  59.08 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  57.73 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  57.93 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  58.33 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  58.33 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  58.21 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  57.14 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  57.64 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3793  threonine aldolase  56.4 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05668  L-allo-threonine aldolase  53.04 
 
 		 334 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000046  low-specificity L-threonine aldolase  53.04 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  57.8 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1686  threonine aldolase  56.09 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  58.09 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4276  L-threonine aldolase  57.43 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2904  L-threonine aldolase  58.6 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0643317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0706  L-allo-threonine aldolase  53.8 
 
 		 343 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  58.79 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  57.35 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52610  hypothetical protein  57.43 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  52.03 
 
 		 333 aa  341  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  52.03 
 
 		 333 aa  341  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  52.03 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  52.03 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3338  L-allo-threonine aldolase  52.48 
 
 		 337 aa  340  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  53.78 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  53.78 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  52.03 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  52.03 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4613  hypothetical protein  57.14 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  51.74 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  53.78 
 
 		 333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  53.78 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  53.78 
 
 		 333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  51.45 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3418  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  55.65 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0582  L-allo-threonine aldolase  50 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.519824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3026  threonine aldolase  52.44 
 
 		 337 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  51.74 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  55.39 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1352  Threonine aldolase  52.44 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000809376  unclonable  0.00000000000146629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  50.14 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1208  L-threonine aldolase  52.48 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000586474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3169  threonine aldolase  51.72 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000533874  unclonable  0.00000438048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3011  threonine aldolase  52.44 
 
 		 337 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000665478  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1278  L-threonine aldolase  52.48 
 
 		 337 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000270333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1207  L-threonine aldolase  52.48 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000862399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2292  threonine aldolase  49.85 
 
 		 337 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.899538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1142  threonine aldolase  50.43 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000636367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1347  threonine aldolase  51.6 
 
 		 336 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000974839  decreased coverage  0.000000417727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2673  threonine aldolase  52.72 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  51.42 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  50.87 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  52.01 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1361  threonine aldolase  54.03 
 
 		 342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000121527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2462  threonine aldolase  54.25 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000261845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  52.57 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  51.72 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2801  threonine aldolase  53.06 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  52.27 
 
 		 337 aa  322  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1448  L-threonine aldolase  55.04 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0097  threonine aldolase  55.33 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1155  threonine aldolase  51.16 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000619042  decreased coverage  0.00631546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1247  threonine aldolase  50.58 
 
 		 336 aa  316  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103654  normal  0.613699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  49 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0162  L-threonine aldolase  48.41 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  43.59 
 
 		 343 aa  271  9e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.09 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  48.12 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_161  threonine aldolase  44.82 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0796  L-threonine aldolase  48.59 
 
 		 340 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.199246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0218  L-threonine aldolase  45.45 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  45.43 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  45.83 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  48.67 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  45.56 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.04 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  45.45 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  40.86 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  50 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  40.86 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3444  Threonine aldolase  45.71 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  46.57 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  45.14 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  44.35 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  42.53 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>