46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2550 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  47.73 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  46.59 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  42.05 
 
 		 213 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  34.57 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  32.69 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.36 
 
 		 178 aa  97.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 181 aa  97.4  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  30.49 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 180 aa  90.9  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  24.12 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.85 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  24.53 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  24.1 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  23.78 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  25.58 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.94 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  24.85 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  24.39 
 
 		 437 aa  61.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.41 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  29.55 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.03 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  23.78 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.95 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.23 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  22.84 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  22.54 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  22.1 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  23.57 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.11 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  22.84 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>