286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1438 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 318 aa  658    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  52.4 
 
 		 306 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  52.75 
 
 		 307 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  45.6 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  43.73 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  43.41 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  42.63 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  41.14 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  41.97 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  41.1 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  43.81 
 
 		 549 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  39.87 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  41.1 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  39.73 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  39.38 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  39.61 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  40.75 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  39.26 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  39.81 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  42.17 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  39 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  38.85 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.24 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  38.14 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.85 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  38.36 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  35.95 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  37.78 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  37.78 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  35.95 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  35.95 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  37.03 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  35.76 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  35.76 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  37.93 
 
 		 309 aa  189  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.22 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  35.45 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  33.85 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  37.06 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  37.58 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  36.01 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  34.47 
 
 		 350 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  36.24 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  33.13 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  34.05 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  36.31 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  34.34 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  34.34 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  34.34 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  34.34 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  34.34 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  34.34 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  34.34 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  37.06 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  32.82 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.38 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  36.33 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.76 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  37 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  33.75 
 
 		 350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  38 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  33.23 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0900  urea amidolyase related protein  36.89 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  38.19 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  37.75 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  33.23 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  35.95 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.23 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  35.19 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  32.92 
 
 		 332 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  32.92 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  32.92 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  38.76 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  33.54 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  33.54 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  34.08 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  35.64 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  33.54 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  33.54 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  35.64 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  35.64 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  35.64 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  37.91 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  33.54 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  35.64 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  35.08 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  36.04 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  34.39 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  34.49 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  34.07 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  38.38 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  33.76 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  34.08 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  34.08 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  34.38 
 
 		 334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.6 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  33.23 
 
 		 389 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  33 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>