More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004307 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  86.63 
 
 		 190 aa  339  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  66.14 
 
 		 189 aa  259  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  56.22 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  55.91 
 
 		 318 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  52.7 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  52.7 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  50.33 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  48.67 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  46.74 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  44.68 
 
 		 198 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 196 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  51.35 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 196 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 196 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  47.97 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  42.16 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  41.62 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  46.71 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  47.06 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  44.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  45.27 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  45.27 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  45.27 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  41.08 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  45.27 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  45.27 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  44.59 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  44.59 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  44.59 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  44.59 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  46.1 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  42.39 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  39.01 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  38.46 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  35.33 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  35.94 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.17 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.43 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  37.36 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  39.34 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.37 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.76 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.84 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.43 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  35.87 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  37.27 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.35 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  35.71 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.55 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  36.56 
 
 		 217 aa  95.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  34.78 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.36 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.73 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  91.3  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  33.87 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  35.29 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  32.98 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  32.8 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  37.97 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  32.43 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  32.62 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  32.98 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  35.64 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  34.78 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  36.59 
 
 		 380 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1543  resolvase domain-containing protein  38 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0184299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 203 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  34.78 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  31.96 
 
 		 211 aa  87.8  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  39.49 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  32.96 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  35.15 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  32.64 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  38.1 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  32.09 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  31.91 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.11 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  37.58 
 
 		 305 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>