56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0032 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  84.48 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  74.14 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  75.44 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  68.97 
 
 		 169 aa  90.5  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  63.79 
 
 		 168 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  63.79 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  68.52 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  66.67 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  66.67 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  67.24 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  67.24 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  67.24 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  67.24 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  67.24 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  64.91 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  64.91 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  67.24 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  64.91 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  67.24 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  63.79 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  56.9 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  55.17 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  60.34 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  60.34 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  53.45 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  62.71 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  62.71 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  53.45 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  61.02 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  60.71 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  53.45 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  60 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  51.72 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  51.72 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  60 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  58.33 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  58.33 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  58.33 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  53.57 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  50.91 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  54 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  54 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  54 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  54 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  54 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  54 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  52 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  54 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  52 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  48 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  46 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  48 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>