85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2424 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  100 
 
 
559 aa  1147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  4.38453e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  32.76 
 
 
568 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  32.17 
 
 
579 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  33.73 
 
 
549 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  32.34 
 
 
563 aa  202  2e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  32.34 
 
 
563 aa  202  2e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  32.04 
 
 
551 aa  201  4e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  31.48 
 
 
574 aa  200  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  30.08 
 
 
550 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  31.41 
 
 
551 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  30.58 
 
 
555 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  25.92 
 
 
544 aa  110  8e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  26.4 
 
 
541 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  25.81 
 
 
527 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  23.91 
 
 
616 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  26.31 
 
 
557 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  26.31 
 
 
557 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  26.31 
 
 
557 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  26.84 
 
 
626 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  26.32 
 
 
554 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  26.32 
 
 
554 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  26.32 
 
 
554 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  26.32 
 
 
554 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  26.43 
 
 
555 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  26.32 
 
 
554 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  25.93 
 
 
555 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  26.32 
 
 
669 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  26.42 
 
 
557 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  25.32 
 
 
606 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  26.37 
 
 
554 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  24.69 
 
 
540 aa  96.3  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  24.92 
 
 
593 aa  94.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  25.84 
 
 
555 aa  93.6  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  24.46 
 
 
578 aa  93.6  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  25.73 
 
 
564 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  26.79 
 
 
573 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  2.3235e-06 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  24.92 
 
 
555 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  22.67 
 
 
619 aa  86.3  1e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  24.1 
 
 
619 aa  85.9  2e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  20.78 
 
 
616 aa  81.3  5e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3287  NERD domain protein  30.3 
 
 
197 aa  79  2e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2836  NERD domain protein  30.3 
 
 
197 aa  79  2e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  25.78 
 
 
554 aa  77.8  5e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  23.75 
 
 
593 aa  77  9e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  22.37 
 
 
613 aa  76.6  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  26.16 
 
 
533 aa  76.3  2e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  26.71 
 
 
558 aa  75.9  2e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.74 
 
 
607 aa  75.9  2e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  23.93 
 
 
612 aa  75.1  3e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  27.48 
 
 
324 aa  70.5  7e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  21.76 
 
 
632 aa  69.7  1e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  24.08 
 
 
625 aa  63.2  1e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  24.8 
 
 
615 aa  61.6  3e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  24.51 
 
 
601 aa  58.5  3e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  30.27 
 
 
617 aa  58.2  4e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  23.25 
 
 
662 aa  57.8  6e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  22.13 
 
 
607 aa  56.6  1e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  24.9 
 
 
662 aa  54.3  5e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  5.32342e-05  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  22.54 
 
 
610 aa  52.8  2e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.09 
 
 
705 aa  52.8  2e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  25.87 
 
 
615 aa  50.8  6e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.33 
 
 
663 aa  50.4  9e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  27.03 
 
 
711 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  22.08 
 
 
830 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  19.26 
 
 
827 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2753  hypothetical protein  39.18 
 
 
129 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.148291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  24.34 
 
 
617 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  19.91 
 
 
780 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  23.42 
 
 
588 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  24.7 
 
 
737 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  24.74 
 
 
631 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0732  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 
929 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  35.16 
 
 
809 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  21.61 
 
 
830 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  26.53 
 
 
799 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  27.13 
 
 
687 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 
697 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  30.04 
 
 
690 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  24.54 
 
 
702 aa  45.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.43 
 
 
755 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  32.47 
 
 
686 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  29.58 
 
 
1328 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  37.68 
 
 
710 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 
702 aa  43.5  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.43 
 
 
766 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>