46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2752 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  32.25 
 
 		 579 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  28.32 
 
 		 568 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  29.96 
 
 		 574 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  34.12 
 
 		 606 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1060  NERD domain protein  26.64 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0134281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  27.48 
 
 		 559 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  38.96 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  37.5 
 
 		 563 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  37.5 
 
 		 563 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1416  NERD domain protein  26.55 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  34.62 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  34.06 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  37.29 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  37.82 
 
 		 557 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  30.66 
 
 		 555 aa  59.3  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  39.5 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  32.85 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  36.97 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  38.14 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  36.97 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  38.14 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  34.48 
 
 		 544 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  33.58 
 
 		 626 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  31.25 
 
 		 615 aa  53.1  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  37.93 
 
 		 669 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  37.93 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  37.93 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  37.93 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  37.93 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  37.93 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  37.93 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  35.11 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  33.59 
 
 		 557 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  34.71 
 
 		 564 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  29.17 
 
 		 558 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.22 
 
 		 593 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  33.62 
 
 		 554 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  27.69 
 
 		 617 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  26.37 
 
 		 616 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  30.41 
 
 		 607 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.96 
 
 		 593 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  36.64 
 
 		 778 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  26.63 
 
 		 617 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  28.06 
 
 		 631 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  29.09 
 
 		 1328 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>