More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1430 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  100 
 
 
500 aa  978    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  35.53 
 
 
506 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  35.35 
 
 
435 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  35.36 
 
 
428 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  38.02 
 
 
427 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  37.94 
 
 
539 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  36.99 
 
 
435 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  35.76 
 
 
425 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  35.53 
 
 
425 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  35.53 
 
 
425 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  35.53 
 
 
425 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  35.53 
 
 
425 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  35.53 
 
 
425 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  35.53 
 
 
425 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  36.26 
 
 
446 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  35.29 
 
 
425 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  36.07 
 
 
428 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.43 
 
 
429 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  35.06 
 
 
425 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  35.06 
 
 
425 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  31.21 
 
 
447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  31.89 
 
 
447 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.57 
 
 
435 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  31.14 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.59 
 
 
433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.49 
 
 
436 aa  219  7e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  35.27 
 
 
484 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  33.78 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  32.63 
 
 
438 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  33.85 
 
 
438 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  33.57 
 
 
446 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  33.88 
 
 
428 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  31.6 
 
 
426 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  30.7 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  33.76 
 
 
428 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.33 
 
 
433 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.33 
 
 
433 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  32.09 
 
 
428 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  30.43 
 
 
439 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  31.78 
 
 
455 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  31.78 
 
 
455 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  30.22 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  31.7 
 
 
427 aa  189  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.65 
 
 
471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  31.62 
 
 
430 aa  183  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  30.5 
 
 
431 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.8 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  31.28 
 
 
427 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  33.17 
 
 
485 aa  180  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  32.11 
 
 
427 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  30.36 
 
 
437 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.1 
 
 
437 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  34.81 
 
 
439 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  35.75 
 
 
433 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.32 
 
 
451 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  35.54 
 
 
478 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  32.09 
 
 
438 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.48 
 
 
435 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  30.89 
 
 
424 aa  172  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  30.98 
 
 
461 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  28.27 
 
 
436 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.8 
 
 
435 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  31.37 
 
 
500 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.51 
 
 
436 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  31.65 
 
 
460 aa  169  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29.71 
 
 
481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  32.58 
 
 
431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.27 
 
 
428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29 
 
 
442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  30.37 
 
 
479 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  30.9 
 
 
458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.23 
 
 
454 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.33 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  31.9 
 
 
474 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.41 
 
 
434 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.24 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  29.95 
 
 
473 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  28.08 
 
 
469 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  29.04 
 
 
479 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.58 
 
 
435 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  28.64 
 
 
434 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  28.57 
 
 
447 aa  156  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  28.02 
 
 
432 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  28.24 
 
 
432 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.9 
 
 
448 aa  156  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  28.24 
 
 
432 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  28.24 
 
 
432 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  28.24 
 
 
432 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  29.7 
 
 
432 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  28.24 
 
 
432 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  28.24 
 
 
432 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  28.24 
 
 
432 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  28.24 
 
 
432 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  28.14 
 
 
507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.8 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  27.99 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  27.99 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  28.93 
 
 
482 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  30.02 
 
 
450 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>