More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1089 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.64 
 
 
762 aa  691    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  45.42 
 
 
772 aa  659    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  46.31 
 
 
778 aa  713    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  45.87 
 
 
790 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  45.94 
 
 
777 aa  733    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.28 
 
 
782 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.13 
 
 
771 aa  677    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
795 aa  1622    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  46.31 
 
 
778 aa  710    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.42 
 
 
783 aa  580  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.15 
 
 
755 aa  570  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.12 
 
 
760 aa  544  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.46 
 
 
760 aa  535  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.9 
 
 
756 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  38.88 
 
 
805 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  38.48 
 
 
817 aa  522  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  39.75 
 
 
811 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.48 
 
 
771 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  39.8 
 
 
802 aa  502  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.07 
 
 
807 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.95 
 
 
773 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.65 
 
 
785 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  37.96 
 
 
808 aa  492  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  37.78 
 
 
788 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.68 
 
 
806 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.42 
 
 
807 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.28 
 
 
902 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.85 
 
 
760 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.46 
 
 
769 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.4 
 
 
791 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.59 
 
 
778 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.04 
 
 
798 aa  469  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  37.18 
 
 
789 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.89 
 
 
760 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.62 
 
 
792 aa  458  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.13 
 
 
803 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.48 
 
 
809 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  35.6 
 
 
740 aa  455  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.62 
 
 
784 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.72 
 
 
768 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  36.19 
 
 
743 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.23 
 
 
790 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  33.96 
 
 
743 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  35.93 
 
 
1037 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  36.28 
 
 
721 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  36.07 
 
 
859 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.24 
 
 
811 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.31 
 
 
757 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.32 
 
 
799 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.11 
 
 
813 aa  422  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  34.31 
 
 
766 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.27 
 
 
752 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.84 
 
 
801 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.9 
 
 
739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.27 
 
 
738 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.59 
 
 
766 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 
772 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.4 
 
 
750 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.03 
 
 
754 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.43 
 
 
769 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4662  glycoside hydrolase family 3 protein  36.1 
 
 
793 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.576806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  33.89 
 
 
727 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.72 
 
 
751 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0699  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 
743 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.788293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  33.84 
 
 
727 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  36.07 
 
 
774 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.45 
 
 
751 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 
702 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.7 
 
 
736 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.79 
 
 
804 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.9 
 
 
769 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  33.55 
 
 
737 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.76 
 
 
772 aa  379  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.24 
 
 
723 aa  376  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 
753 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  34.54 
 
 
765 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  34.41 
 
 
755 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  34.41 
 
 
755 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  34.54 
 
 
755 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  35.32 
 
 
768 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  34.28 
 
 
755 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.34 
 
 
765 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 
764 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.39 
 
 
742 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  32.73 
 
 
745 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.6 
 
 
714 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  33.63 
 
 
765 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.63 
 
 
765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.51 
 
 
765 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
751 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.69 
 
 
733 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  33.63 
 
 
765 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  33.51 
 
 
765 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 
765 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  33.51 
 
 
765 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  33.51 
 
 
765 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  33.63 
 
 
765 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  33.88 
 
 
759 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  33.38 
 
 
765 aa  364  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 
763 aa  364  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>