149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1361 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  45.43 
 
 		 882 aa  749    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  100 
 
 		 854 aa  1731    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  48.48 
 
 		 835 aa  787    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  88 
 
 		 854 aa  1554    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  84.27 
 
 		 853 aa  1489    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  86.79 
 
 		 853 aa  1520    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  44.67 
 
 		 877 aa  704    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  55.92 
 
 		 871 aa  981    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 852 aa  635  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  27.7 
 
 		 781 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  28.43 
 
 		 794 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  28.83 
 
 		 786 aa  212  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  28.34 
 
 		 785 aa  211  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  28.07 
 
 		 783 aa  206  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  29.1 
 
 		 784 aa  200  9e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  27.17 
 
 		 780 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  27.42 
 
 		 781 aa  191  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  26.83 
 
 		 780 aa  189  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  25.22 
 
 		 810 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  24.28 
 
 		 783 aa  150  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  23.19 
 
 		 811 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  23.72 
 
 		 812 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  28.37 
 
 		 607 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  28.93 
 
 		 1463 aa  129  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  24.91 
 
 		 818 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  25.89 
 
 		 723 aa  124  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  30.27 
 
 		 1485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  25.68 
 
 		 784 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  25.49 
 
 		 912 aa  114  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  28.57 
 
 		 1459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  24.34 
 
 		 787 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  26.92 
 
 		 796 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  23.12 
 
 		 788 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.75 
 
 		 794 aa  108  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  25.48 
 
 		 982 aa  104  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  23.87 
 
 		 795 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  23.35 
 
 		 716 aa  103  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  23.65 
 
 		 941 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  27.51 
 
 		 990 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  24.96 
 
 		 790 aa  101  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  24.83 
 
 		 821 aa  100  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  23.91 
 
 		 791 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  21.82 
 
 		 932 aa  97.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  24.93 
 
 		 768 aa  97.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  23.27 
 
 		 910 aa  96.3  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  24.24 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.94 
 
 		 787 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  23.95 
 
 		 782 aa  95.9  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  23.48 
 
 		 816 aa  94.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  24.78 
 
 		 786 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1444  DNA polymerase B region  27.88 
 
 		 562 aa  93.6  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  27.11 
 
 		 1044 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  24.27 
 
 		 786 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  24.2 
 
 		 787 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1185  DNA polymerase I  22.92 
 
 		 657 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000674312  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  25.62 
 
 		 929 aa  92.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  23.97 
 
 		 786 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  24.64 
 
 		 786 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  23.12 
 
 		 789 aa  91.3  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  23.89 
 
 		 1353 aa  91.3  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.29 
 
 		 792 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  23.84 
 
 		 788 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  23.17 
 
 		 655 aa  90.1  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.95 
 
 		 783 aa  89  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  22.8 
 
 		 1070 aa  89.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.95 
 
 		 783 aa  89  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.95 
 
 		 783 aa  89  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.95 
 
 		 783 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  22.37 
 
 		 818 aa  88.6  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.95 
 
 		 783 aa  88.2  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.95 
 
 		 783 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  24.05 
 
 		 1058 aa  88.2  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  23.49 
 
 		 794 aa  87.8  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  24.32 
 
 		 1087 aa  87.4  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  23.63 
 
 		 794 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  23.63 
 
 		 794 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.95 
 
 		 783 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  23.38 
 
 		 787 aa  86.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  23.51 
 
 		 783 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  23.31 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.8 
 
 		 783 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  23.38 
 
 		 793 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 783 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  23.45 
 
 		 788 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 786 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 786 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  23.55 
 
 		 783 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  26.95 
 
 		 552 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0296  DNA polymerase B region  22.39 
 
 		 743 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413746  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  23.52 
 
 		 791 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  24.07 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  23.47 
 
 		 783 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  24.23 
 
 		 821 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  24.59 
 
 		 789 aa  78.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  21.28 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  22.62 
 
 		 820 aa  78.2  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  23.24 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  21.81 
 
 		 810 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  21.66 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>