47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2535 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  100 
 
 
223 aa  424  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  26.54 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  26.57 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  29.25 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  28.08 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  28.29 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  26.98 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  29.72 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  25.7 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  25.6 
 
 
259 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  25.12 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  25.12 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  25.82 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  23.45 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  26.42 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  25.12 
 
 
253 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  52 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  26.76 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  24.88 
 
 
255 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  24.77 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  22.97 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  24.76 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  52.17 
 
 
234 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  44.68 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  41.51 
 
 
234 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  46.15 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  46.15 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  41.51 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  21.6 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  28.96 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  46.15 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  46.15 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  36.62 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  33.87 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  24.43 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  22.27 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  31.08 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  28.21 
 
 
291 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  23.85 
 
 
259 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  21.43 
 
 
250 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  33.33 
 
 
240 aa  41.6  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>