More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3080 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  634    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  58.86 
 
 		 209 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  37.56 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  42.24 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  38.97 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  47.33 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 210 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 		 210 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 210 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  38.51 
 
 		 210 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  36.65 
 
 		 211 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  35.4 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  39.24 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 210 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  39.07 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  40.49 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.16 
 
 		 198 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 		 210 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  37.69 
 
 		 203 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  35.5 
 
 		 204 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  30.92 
 
 		 199 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 203 aa  99  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 199 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 		 187 aa  99  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  34.57 
 
 		 197 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 197 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 		 215 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 198 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  30.49 
 
 		 190 aa  97.1  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  32.79 
 
 		 210 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 207 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 219 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 185 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  32.24 
 
 		 220 aa  96.3  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  30.94 
 
 		 210 aa  96.3  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 220 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  29.69 
 
 		 208 aa  95.9  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  29.69 
 
 		 208 aa  95.9  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 199 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  38.24 
 
 		 226 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.88 
 
 		 198 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  32.37 
 
 		 219 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  28.99 
 
 		 206 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 210 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 195 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 197 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  35.94 
 
 		 197 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  35.11 
 
 		 193 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 197 aa  92.4  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 192 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.34 
 
 		 197 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 204 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 200 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  38.61 
 
 		 209 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  32.46 
 
 		 205 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  32.46 
 
 		 205 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  34.85 
 
 		 197 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  32.46 
 
 		 205 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  32.46 
 
 		 205 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  31.94 
 
 		 204 aa  89.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  32.67 
 
 		 213 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  36.21 
 
 		 192 aa  89.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  29.84 
 
 		 219 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  29.84 
 
 		 219 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  38.58 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  32.58 
 
 		 205 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  38.4 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  30.97 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  29.84 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  38.4 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  28.39 
 
 		 196 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 196 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 209 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 218 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 200 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 226 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  38.26 
 
 		 275 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 211 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  33.11 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  30.92 
 
 		 201 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 212 aa  86.7  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  29.57 
 
 		 211 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 		 214 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  39.66 
 
 		 181 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  39.66 
 
 		 181 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  39.66 
 
 		 181 aa  86.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  37.39 
 
 		 217 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  29.05 
 
 		 239 aa  86.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  37.39 
 
 		 226 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  33.86 
 
 		 191 aa  85.9  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 205 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  36.7 
 
 		 219 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>