More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1669 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 217 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35.55 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  32 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0867  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 251 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 251 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0914  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 275 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0899  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 250 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 246 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  32.49 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 246 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>