More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0941 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  100 
 
 		 159 aa  330  6e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  46.77 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  46.77 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  39.24 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  37.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  37.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  37.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  37.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  37.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  37.18 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  37.18 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  37.18 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  39.88 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  37.18 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  36.54 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  46.43 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  37.58 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  37.58 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 302 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 196 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  39.16 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  37.66 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  33.76 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  36.07 
 
 		 226 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 		 188 aa  97.1  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  36.36 
 
 		 225 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  31.74 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  39.72 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1300  NLP/P60 protein  40.8 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  38.33 
 
 		 191 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  43.86 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 214 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  36.6 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 		 190 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 		 190 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 		 190 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  35.03 
 
 		 205 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  38.97 
 
 		 226 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 214 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  38.21 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 424 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  38.21 
 
 		 198 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 342 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  43.52 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  41.67 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 223 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  46.02 
 
 		 242 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  36.23 
 
 		 221 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  36.36 
 
 		 223 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 230 aa  92.8  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 223 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  39.09 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  31.79 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  39.73 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  36.92 
 
 		 342 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  31.52 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  39.37 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 208 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 208 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 214 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  33.56 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 208 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 207 aa  91.3  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 207 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  34.85 
 
 		 224 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 365 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  35.83 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 365 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  38.76 
 
 		 181 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  35.61 
 
 		 234 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.16 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 224 aa  90.9  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  35.61 
 
 		 234 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  35.61 
 
 		 234 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 207 aa  90.5  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  37.19 
 
 		 218 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  37.19 
 
 		 218 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  35.61 
 
 		 234 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  37.19 
 
 		 218 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  37.19 
 
 		 218 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.5 
 
 		 331 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>