More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0767 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0767  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
208 aa  420  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 
206 aa  193  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  45.54 
 
 
218 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 
218 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 
211 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46.53 
 
 
217 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 
219 aa  189  3e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 
217 aa  189  3e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 
210 aa  187  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  47.09 
 
 
206 aa  187  8e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  43.87 
 
 
217 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  46.38 
 
 
214 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.79377e-07  decreased coverage  1.16579e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 
209 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 
205 aa  187  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  43.87 
 
 
217 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  43.87 
 
 
217 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 
210 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  50.49 
 
 
206 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  6.08869e-05  hitchhiker  2.69964e-11 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 
209 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.15 
 
 
216 aa  185  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  43.69 
 
 
218 aa  184  1e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 
211 aa  183  1e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 
208 aa  184  1e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
212 aa  184  1e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  45.37 
 
 
211 aa  183  2e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 
211 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 
243 aa  182  5e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
208 aa  181  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 
210 aa  181  8e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  47.12 
 
 
212 aa  181  8e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 
210 aa  181  8e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 
210 aa  181  9e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  44.88 
 
 
209 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 
210 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
210 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  43.9 
 
 
209 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
209 aa  179  3e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 
290 aa  179  3e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 
251 aa  178  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 
209 aa  178  5e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 
207 aa  177  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.63563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 
209 aa  177  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 
207 aa  177  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 
210 aa  177  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  45.93 
 
 
211 aa  176  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 
210 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0265  50S ribosomal protein L3  45.85 
 
 
232 aa  176  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.58657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  42.08 
 
 
206 aa  174  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 
212 aa  174  1e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.77342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 
209 aa  174  1e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  41.43 
 
 
219 aa  174  1e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  44.22 
 
 
213 aa  174  1e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  43.27 
 
 
216 aa  172  2e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  43.75 
 
 
209 aa  172  2e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  44.86 
 
 
211 aa  173  2e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 
251 aa  173  2e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  6.66211e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
212 aa  173  2e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  42.06 
 
 
220 aa  173  2e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  44.23 
 
 
209 aa  172  2e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.22247e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  42.23 
 
 
209 aa  173  2e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
227 aa  172  3e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 
279 aa  172  4e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  44.23 
 
 
212 aa  172  4e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.8687e-07  unclonable  4.91767e-12 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
208 aa  172  4e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.58228e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 
257 aa  172  4e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 
246 aa  171  6e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 
246 aa  171  6e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  41.26 
 
 
211 aa  171  7e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  1.65351e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 
242 aa  171  7e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  43.06 
 
 
212 aa  171  8e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  1.5584e-06  hitchhiker  7.58128e-06 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 
226 aa  171  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  41.55 
 
 
219 aa  170  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  43.27 
 
 
213 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  42.23 
 
 
211 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.30335e-05  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  43 
 
 
246 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  42.23 
 
 
211 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 
216 aa  170  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 
246 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  40.78 
 
 
211 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  42.03 
 
 
218 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 
212 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0815  50S ribosomal protein L3  44.39 
 
 
221 aa  169  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000249143  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 
239 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  43.41 
 
 
220 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  41.95 
 
 
207 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.58376e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  42.72 
 
 
210 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.31463e-05  hitchhiker  3.31617e-13 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 
245 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  42.23 
 
 
222 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  43.75 
 
 
209 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  41.26 
 
 
211 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.74535e-10  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  45.63 
 
 
216 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  42.86 
 
 
219 aa  168  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 
237 aa  168  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>