More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0265 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0265  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658657  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  55.35 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  48.13 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  48.5 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  45.63 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 204 aa  195  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  45.54 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  44.86 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  46.8 
 
 		 209 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  43.9 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 211 aa  191  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  44.12 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 211 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  45.32 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  42.92 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  45.32 
 
 		 210 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 210 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  43.2 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  43.14 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 211 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 209 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 211 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  47.26 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  44.83 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  44.33 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 211 aa  183  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  43.56 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  43.56 
 
 		 211 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  43.14 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 214 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  47.18 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  44.12 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  44.06 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  43.63 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  44.06 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  45.85 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  43.9 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  44.39 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  44.72 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  44.06 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  44.06 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>