More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0298 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  50.75 
 
 		 277 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 257 aa  207  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  54.31 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  53.81 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  47.93 
 
 		 256 aa  198  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.98 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 242 aa  187  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  48.24 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.49 
 
 		 259 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.26 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  45.19 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  48.57 
 
 		 255 aa  181  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  48.57 
 
 		 255 aa  181  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 257 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  50.74 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  50.74 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  50.74 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 260 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  51.02 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  53.01 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  49.22 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 256 aa  174  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  49.76 
 
 		 208 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  47.96 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  49.21 
 
 		 269 aa  171  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.92 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  48.08 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  50.99 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  43.87 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 338 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  52.75 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 255 aa  168  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  50 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.45 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  51.3 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  48.47 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  48.98 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2303  ribonuclease HII  51.83 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000380421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  48 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  50 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  45.88 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  47.03 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.28 
 
 		 197 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  47.31 
 
 		 197 aa  161  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>