102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13266 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  305  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  78.12 
 
 		 177 aa  247  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  78.12 
 
 		 177 aa  247  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  78.12 
 
 		 177 aa  247  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  67.11 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  57.32 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  56.13 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 		 186 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  50.62 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  48.75 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  48.75 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  41.88 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  50 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  44.38 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  47.5 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  41.14 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  41.88 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  46.84 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  46.2 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  39.38 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  39.49 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  35 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  28.48 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  28.31 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  25.47 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  26.51 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  32.89 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  25.81 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  30 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  31.68 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  26.58 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  30.3 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  27.71 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  26.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  26.58 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  26.58 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  26.58 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  33.75 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  26.58 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  26.35 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  26.35 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  26.35 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  26.35 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  26.35 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  26.35 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  26.35 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  25.68 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  25.68 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  24.52 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 		 674 aa  53.9  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  52.17 
 
 		 662 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  24.07 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 		 673 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 405 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  32.26 
 
 		 212 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 		 335 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  41.51 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 684 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 		 667 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 671 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 335 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 		 674 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  44 
 
 		 541 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  26.83 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  36 
 
 		 697 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  29 
 
 		 233 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 636 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  50 
 
 		 221 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 401 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  42 
 
 		 544 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  41.6  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  50 
 
 		 221 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  45.83 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 672 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 542 aa  41.2  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  29.91 
 
 		 405 aa  41.2  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  40.68 
 
 		 399 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  47.5 
 
 		 221 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>