More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0094 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
311 aa  606  1e-172  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  55.87 
 
 
320 aa  340  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  57.14 
 
 
319 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  57.14 
 
 
319 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  54.31 
 
 
317 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  52.88 
 
 
320 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  52.92 
 
 
318 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.65 
 
 
325 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  49.35 
 
 
326 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  52.63 
 
 
314 aa  244  2e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  40.13 
 
 
319 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  39.3 
 
 
319 aa  236  5e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  48.87 
 
 
318 aa  235  8e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  36.1 
 
 
325 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  39.49 
 
 
306 aa  197  2e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  35.53 
 
 
307 aa  182  5e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  32.07 
 
 
319 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  27.39 
 
 
319 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  27.54 
 
 
320 aa  115  8e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.67 
 
 
335 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 
343 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  33.33 
 
 
321 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.00228e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  27.24 
 
 
320 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  34.36 
 
 
389 aa  106  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.55 
 
 
331 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.58 
 
 
326 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.67 
 
 
320 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.90012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.66 
 
 
358 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  3.42072e-10 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.34 
 
 
485 aa  99  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.84 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  26.64 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  32.64 
 
 
652 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.82 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.31 
 
 
589 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 
363 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.31 
 
 
695 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  29.75 
 
 
339 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.17 
 
 
343 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.08 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.87 
 
 
320 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.34 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.43 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.2 
 
 
373 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.72 
 
 
359 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.32 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54633e-15 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.17 
 
 
663 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.09 
 
 
650 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  29.2 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  29.15 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  29.86 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.43 
 
 
339 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.51 
 
 
565 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.1 
 
 
338 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  30.51 
 
 
565 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.33 
 
 
730 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  30.9 
 
 
650 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.05 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.69 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.63 
 
 
648 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.31 
 
 
613 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.04981e-05  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  34.78 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.26 
 
 
641 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.61 
 
 
517 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.26 
 
 
344 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88191e-06 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.36 
 
 
347 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.55 
 
 
610 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.57 
 
 
395 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.38 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1761  DNA polymerase III subunits gamma/tau  33.56 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.96 
 
 
354 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.91 
 
 
575 aa  85.9  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.42 
 
 
340 aa  85.1  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.23 
 
 
595 aa  85.1  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  26.54 
 
 
308 aa  85.1  1e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.32 
 
 
323 aa  85.1  1e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.65 
 
 
724 aa  85.5  1e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.64 
 
 
383 aa  85.5  1e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.58 
 
 
337 aa  85.5  1e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  26.54 
 
 
308 aa  85.1  1e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  29.56 
 
 
327 aa  84.7  2e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.04 
 
 
560 aa  84.3  2e-15  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.88 
 
 
562 aa  84.7  2e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
327 aa  84.7  2e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
327 aa  84.7  2e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 
318 aa  84.7  2e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.83 
 
 
455 aa  84.3  2e-15  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
327 aa  84  3e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.23 
 
 
351 aa  84  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
327 aa  84  3e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  29.56 
 
 
327 aa  84  3e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  28.57 
 
 
327 aa  84  3e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0099  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.11 
 
 
603 aa  84  3e-15  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  28.11 
 
 
559 aa  84  3e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.11 
 
 
562 aa  84  3e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 
327 aa  84  3e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.34 
 
 
562 aa  83.6  4e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  29.06 
 
 
327 aa  83.6  4e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.34 
 
 
562 aa  83.6  4e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>