236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1232 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  100 
 
 		 384 aa  761    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  64.21 
 
 		 403 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  56.51 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  51.81 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  52.59 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  48.97 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  51.84 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  51.58 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  54.94 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  45.79 
 
 		 386 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  42.37 
 
 		 394 aa  312  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  38.56 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  40.69 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  40.54 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  40.54 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  38.54 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  42.31 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  42.31 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  40.16 
 
 		 391 aa  270  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  39.05 
 
 		 374 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  32.88 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  34.32 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.02 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  30.96 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27.18 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.2 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.99 
 
 		 792 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.6 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 1040 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 		 1096 aa  96.3  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.04 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 1153 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.94 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  29.88 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.08 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.72 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.74 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.04 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.75 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 1061 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  29.41 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.39 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.22 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  27.48 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  36.88 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  26.94 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.48 
 
 		 1061 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 1111 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.96 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.89 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  28.29 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  28.03 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.43 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  23.82 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  24.16 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  27.83 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.79 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.5 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  25.51 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  25.67 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.33 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.84 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  23.34 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  36.46 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.03 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  23.01 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  24.61 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  28.34 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  24.85 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>