More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2534 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  54.86 
 
 		 639 aa  701    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  59 
 
 		 650 aa  764    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  56.3 
 
 		 655 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  56.54 
 
 		 648 aa  769    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  54.37 
 
 		 652 aa  692    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  100 
 
 		 670 aa  1363    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  51.05 
 
 		 619 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  51.05 
 
 		 619 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  41.53 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  42.97 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  43.06 
 
 		 575 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  41.73 
 
 		 558 aa  389  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  42.36 
 
 		 570 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  42.36 
 
 		 570 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  40.72 
 
 		 566 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  41.13 
 
 		 560 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  41.57 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  41.67 
 
 		 556 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  42.23 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  41.63 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  41.43 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  41.83 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  42.01 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  41.9 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  41.58 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  41.48 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  41.48 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  41.48 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  41.48 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  41.24 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  41.48 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  42.22 
 
 		 557 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  40.23 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  39.92 
 
 		 537 aa  359  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.45 
 
 		 563 aa  357  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  29.4 
 
 		 635 aa  141  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  28.06 
 
 		 662 aa  138  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  27.77 
 
 		 645 aa  134  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  29.3 
 
 		 765 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  27.03 
 
 		 631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  27.72 
 
 		 680 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  27.68 
 
 		 638 aa  127  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  27.31 
 
 		 637 aa  125  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  27.93 
 
 		 698 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  27.13 
 
 		 632 aa  122  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  29.45 
 
 		 808 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  31.65 
 
 		 809 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 		 821 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  26.84 
 
 		 898 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  26.14 
 
 		 805 aa  117  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  25.97 
 
 		 821 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  34.15 
 
 		 806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  34.15 
 
 		 806 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  27.59 
 
 		 693 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  31.02 
 
 		 816 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  25.75 
 
 		 816 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  28.47 
 
 		 731 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  34.62 
 
 		 804 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  34 
 
 		 859 aa  114  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  26.24 
 
 		 802 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  33.88 
 
 		 799 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  24.28 
 
 		 812 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  26.14 
 
 		 802 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  25.83 
 
 		 802 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  25.58 
 
 		 711 aa  114  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  35.36 
 
 		 875 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  35.36 
 
 		 874 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  25.48 
 
 		 823 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  26.7 
 
 		 756 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  35.52 
 
 		 809 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  26.48 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  32.97 
 
 		 802 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  27.18 
 
 		 778 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  24.96 
 
 		 830 aa  110  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1556  ATP-dependent protease La  31.27 
 
 		 813 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 785 aa  110  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  32.41 
 
 		 813 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  31.38 
 
 		 799 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  24.96 
 
 		 820 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 816 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  36.67 
 
 		 805 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 813 aa  109  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  32.45 
 
 		 818 aa  109  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 813 aa  108  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  34.17 
 
 		 802 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  34.86 
 
 		 806 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  33.52 
 
 		 804 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  26.43 
 
 		 880 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0754  ATP-dependent endopeptidase Lon  26.23 
 
 		 817 aa  107  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.261769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  32.97 
 
 		 823 aa  107  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  25.24 
 
 		 809 aa  107  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  25.05 
 
 		 798 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  33.52 
 
 		 805 aa  107  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  31.8 
 
 		 815 aa  107  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  26.23 
 
 		 817 aa  107  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  25.36 
 
 		 808 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  25.05 
 
 		 798 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  25.65 
 
 		 768 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  26.8 
 
 		 813 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  25.88 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>