117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1788 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  100 
 
 		 746 aa  1548    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  45.01 
 
 		 750 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  44.73 
 
 		 762 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  43.15 
 
 		 769 aa  625  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  43.4 
 
 		 749 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  39.66 
 
 		 757 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  36.89 
 
 		 752 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  37.96 
 
 		 752 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  31.76 
 
 		 745 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  31.5 
 
 		 745 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  30.72 
 
 		 745 aa  357  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  30.8 
 
 		 745 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  30.8 
 
 		 745 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  31.76 
 
 		 756 aa  343  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  31.72 
 
 		 844 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  31.48 
 
 		 769 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  31.27 
 
 		 766 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  31 
 
 		 763 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  31 
 
 		 763 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  30.88 
 
 		 763 aa  334  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  36.42 
 
 		 716 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  30.6 
 
 		 727 aa  313  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  31.6 
 
 		 736 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  25.98 
 
 		 649 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  25.77 
 
 		 649 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  25 
 
 		 649 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  24.69 
 
 		 649 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  24.69 
 
 		 649 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  25.19 
 
 		 647 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  25.15 
 
 		 649 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  24.54 
 
 		 649 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  24.54 
 
 		 649 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  26.26 
 
 		 649 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  24.54 
 
 		 649 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  24.04 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  23.77 
 
 		 630 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  24.32 
 
 		 647 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  23.4 
 
 		 630 aa  134  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  23.69 
 
 		 657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  23.5 
 
 		 641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  24.51 
 
 		 607 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  22.63 
 
 		 644 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  26.45 
 
 		 669 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  27.82 
 
 		 403 aa  117  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  24.76 
 
 		 404 aa  115  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  26.68 
 
 		 438 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  26.03 
 
 		 403 aa  108  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.48 
 
 		 403 aa  108  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.24 
 
 		 403 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.4 
 
 		 426 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  25.05 
 
 		 437 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  24.05 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  29.19 
 
 		 397 aa  102  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  25.88 
 
 		 584 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  25.3 
 
 		 404 aa  97.8  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  23.46 
 
 		 424 aa  97.8  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  23.89 
 
 		 400 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  23.82 
 
 		 400 aa  96.3  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  24.94 
 
 		 575 aa  95.9  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  22.38 
 
 		 400 aa  94  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  23.76 
 
 		 628 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  26.97 
 
 		 436 aa  87.4  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  23.5 
 
 		 403 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  26.24 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  24.64 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  24.35 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  28.12 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  36.75 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  24.93 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  22.24 
 
 		 644 aa  70.9  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  24.86 
 
 		 555 aa  69.7  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  24.19 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  34.65 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  27.39 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  24.26 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  23.71 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  23.47 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  26.5 
 
 		 635 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  23.43 
 
 		 584 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  22.95 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  29.63 
 
 		 420 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  25 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  25.4 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  25.2 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  23.08 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3717  hypothetical protein  20.32 
 
 		 353 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  24.68 
 
 		 405 aa  60.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  26.38 
 
 		 416 aa  60.1  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  22.13 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  23.91 
 
 		 618 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  23.27 
 
 		 590 aa  54.3  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.31 
 
 		 248 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3627  hypothetical protein  25.11 
 
 		 407 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0995  protein of unknown function DUF181  25.31 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.33 
 
 		 354 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  24.38 
 
 		 600 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  22.11 
 
 		 570 aa  52  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.3 
 
 		 249 aa  52  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0918  hypothetical protein  27.41 
 
 		 272 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.28 
 
 		 253 aa  51.6  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>