198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0929 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  36.36 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  31.68 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  31.4 
 
 		 281 aa  85.1  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  32.57 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  27.83 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  29.25 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  26.02 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  29.64 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  29.78 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.13 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  29.67 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  29.08 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.38 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  30.04 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  28.7 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  30.17 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.8 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  27.14 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  32.24 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.68 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  28.81 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  29.55 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  30.04 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  30.04 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  26.84 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  29.18 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 305 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  29.15 
 
 		 409 aa  62  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  29.31 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  25.94 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  25.59 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  28.31 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  28.31 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.03 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  25.2 
 
 		 410 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  25.66 
 
 		 410 aa  58.5  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  24.57 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  28.45 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  27.8 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  25.75 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  31.78 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  27.78 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  25.11 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.75 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  26.83 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  27.85 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  28.38 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  27.05 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  27.35 
 
 		 406 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  25.11 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.47 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  26.32 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  24.88 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  26.73 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 290 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  26.05 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  26.36 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  23.96 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  27.92 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  27.37 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  27.35 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  24.45 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.12 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  29.46 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  29 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  24.24 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.23 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  31.93 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24.14 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  25.28 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.3 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  33.04 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 313 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  32.71 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  38.2 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  23.83 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  23 
 
 		 284 aa  48.5  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  27.06 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  25.93 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  22.6 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>