More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0773 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  54.63 
 
 		 235 aa  228  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  53.74 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  51.08 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  53.74 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  49.78 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  49.76 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  47.6 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  49.77 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  48.58 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  48.68 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  46.23 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  44.08 
 
 		 241 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  44.08 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  49.03 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  49.03 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  48.54 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  45.13 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  48.54 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  47.64 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  47.64 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  47.64 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  47.64 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  48.54 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  48.54 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  48.5 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  47.85 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  49 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  48.15 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  49.75 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  43.54 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  45.41 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  41.89 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  41.89 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  45.12 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.59 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  42.48 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  47.34 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  45.88 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  48.08 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  45.54 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  45.24 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  40.97 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  44.76 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  48.74 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.84 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  45.12 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  45.12 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  45.37 
 
 		 385 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  40.76 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  41.55 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  41.1 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  41.55 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  41.23 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  44.55 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  46.91 
 
 		 383 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  46.91 
 
 		 383 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  45.23 
 
 		 377 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  46.57 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  40.64 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  46.08 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  43.87 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  43.06 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.03 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  44.93 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  43.4 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  40.09 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  45.13 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  43.28 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  41.23 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.06 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.29 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  41.63 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  41.98 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  41.98 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  44.02 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  42.58 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  44.34 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  44.55 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  41.78 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  47.45 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  44.02 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  41.43 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  44.9 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  43.35 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.38 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  39.6 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  42.59 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  44.1 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  41.41 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  46.43 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  45.96 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  43.6 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  41.59 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  50.56 
 
 		 270 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  42.33 
 
 		 258 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  45.31 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  44.29 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  42.5 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  48.26 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>