More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  80.73 
 
 		 438 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  100 
 
 		 446 aa  914    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  69.34 
 
 		 437 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  71.06 
 
 		 446 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  70.35 
 
 		 439 aa  623  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  66.98 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  65.41 
 
 		 441 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  65.49 
 
 		 438 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  62.33 
 
 		 440 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  62.97 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  64.49 
 
 		 454 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  61.97 
 
 		 436 aa  551  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  64.3 
 
 		 611 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  61.92 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  63.73 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  63.97 
 
 		 416 aa  537  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  59.03 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  59.31 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  51.95 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  53.15 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  46 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  42.09 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  42.2 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.71 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.55 
 
 		 400 aa  335  7e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  41.6 
 
 		 404 aa  319  7e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 399 aa  310  4e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  41.06 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 399 aa  306  6e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 395 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.03 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 		 397 aa  299  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.28 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.6 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.78 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 413 aa  293  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.79 
 
 		 398 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  40.2 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.56 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.79 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.07 
 
 		 393 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.1 
 
 		 393 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 393 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.1 
 
 		 393 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 395 aa  289  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.59 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.44 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  41.19 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.56 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.56 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.56 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.56 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.56 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.56 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  36.87 
 
 		 397 aa  282  9e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.15 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.72 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 405 aa  276  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.56 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  33 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  34.43 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.07 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>