118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 515 aa  1020    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  40.41 
 
 		 494 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  37.63 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  37.7 
 
 		 503 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  39.55 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  36.05 
 
 		 504 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  36.2 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  32.36 
 
 		 477 aa  240  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 		 491 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  33.13 
 
 		 492 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  33.13 
 
 		 492 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  33.54 
 
 		 506 aa  216  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  33.46 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  32.59 
 
 		 517 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  35.98 
 
 		 494 aa  203  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  35.94 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  33.41 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.98 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 		 797 aa  149  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  31.25 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  31.57 
 
 		 509 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  27.34 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  25.44 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  25.19 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  25.5 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  25.95 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  24.04 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  27.23 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  24.1 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  25.69 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  26.9 
 
 		 390 aa  67  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  26.33 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  24.36 
 
 		 379 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  25.71 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  27.78 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  28.64 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  24.4 
 
 		 392 aa  62  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  25 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  27.39 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  25.87 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  24.06 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  22.82 
 
 		 379 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  23.59 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  21.88 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  23.75 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  28.87 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  26 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  26.44 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  25.51 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  23.44 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2711  acetyl-CoA acetyltransferase  31.76 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2967  hypothetical protein  26.63 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  25.77 
 
 		 383 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  23.72 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  22.88 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  23.81 
 
 		 388 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  34.58 
 
 		 388 aa  54.7  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  26.32 
 
 		 387 aa  54.3  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5540  putative acetyl-CoA C-acyltransferase  25.97 
 
 		 364 aa  53.5  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  24.71 
 
 		 390 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  27.23 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  25.77 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  22.78 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  23.68 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1244  acetyl-CoA acetyltransferase  27.09 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.023257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  23.42 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0758  hypothetical protein  28.05 
 
 		 357 aa  51.2  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  22.5 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  22.75 
 
 		 395 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  27.32 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  26.45 
 
 		 381 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  26.26 
 
 		 390 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1637  acetyl-CoA acetyltransferase  30.07 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.322662  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  25.7 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  25.7 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  24.16 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.91 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  26.62 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2349  acetyl-CoA acetyltransferase  28.67 
 
 		 415 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  25.38 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  25.25 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  22.84 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  27.27 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  21.25 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0697  acetyl-CoA acetyltransferases  26.25 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.723631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  23.85 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4577  acetyl-CoA acetyltransferase  27.49 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4334  normal  0.466675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  25.39 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  25.5 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4151  acetyl-CoA acetyltransferase  27.5 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409684  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  29.44 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  26.84 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  28.83 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>