More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1529 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  100 
 
 		 163 aa  327  6e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  58.18 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  56.97 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  64.54 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.07 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.07 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  54.07 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  52.3 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  45.64 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  45.74 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  43.85 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  44.96 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  40 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  40 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  38.57 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.31 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  36.67 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  36.67 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  41.43 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  37.24 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  37.24 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  43.2 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  37.67 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  37.96 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  41.3 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  41.27 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  40.94 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35.4 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  36.36 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  40.3 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  39.47 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  36.43 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  30.52 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  30.52 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.04 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38.81 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.31 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  37.88 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  32.85 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  34.57 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  35.1 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  34.31 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  29.87 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.46 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  34.81 
 
 		 262 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.12 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  34.38 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.04 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  39.29 
 
 		 533 aa  94.4  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  35.14 
 
 		 189 aa  94.4  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  32 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.43 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  30.71 
 
 		 238 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.03 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.87 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.22 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.87 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  37.86 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  36.09 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  30.43 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  36.09 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  36.09 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  46.6 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  30.43 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  30.43 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  35.34 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  29.71 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  32.3 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  32.84 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  32.84 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  35.86 
 
 		 275 aa  90.9  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.57 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  30.12 
 
 		 479 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  34.07 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  32.14 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  35.34 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  38.71 
 
 		 518 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  32.14 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.11 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.49 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.58 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  37.68 
 
 		 194 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  34.59 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  36.3 
 
 		 276 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  34.07 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  31.33 
 
 		 253 aa  89  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  33.58 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  35.04 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>