96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1317 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  749    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  47.76 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  42.94 
 
 
350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  44.62 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  38.1 
 
 
232 aa  139  7e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  46.21 
 
 
160 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  47.54 
 
 
131 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  47.62 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  44.96 
 
 
162 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  44.8 
 
 
160 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  40.8 
 
 
170 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  35.24 
 
 
918 aa  112  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  42.42 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  41.6 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  40.8 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  41.67 
 
 
162 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  43.51 
 
 
158 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  44.07 
 
 
152 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  36.15 
 
 
156 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  36.97 
 
 
151 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  34.85 
 
 
170 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  33.85 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  36.21 
 
 
185 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  39.82 
 
 
119 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  29.41 
 
 
210 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  32.85 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  32.58 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  31.25 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2965  NosL family protein  30.52 
 
 
166 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0917771  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  32.85 
 
 
204 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  30.3 
 
 
196 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  31.11 
 
 
167 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  30.15 
 
 
163 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  31.06 
 
 
200 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  31.06 
 
 
200 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  30.15 
 
 
163 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0302  hypothetical protein  31.9 
 
 
187 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000425724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  30.83 
 
 
172 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  33.09 
 
 
188 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  31.62 
 
 
163 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  30.6 
 
 
172 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  30.15 
 
 
163 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
203 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  31.5 
 
 
228 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  30.37 
 
 
173 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  27.4 
 
 
162 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  31.4 
 
 
165 aa  56.6  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  28.57 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  32.52 
 
 
181 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  28.57 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 
201 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  28.79 
 
 
193 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  28 
 
 
171 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  32 
 
 
181 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  28.47 
 
 
205 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  29.69 
 
 
166 aa  53.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  30.15 
 
 
163 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  28.8 
 
 
162 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  30.63 
 
 
172 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  27.69 
 
 
181 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  30.88 
 
 
163 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  26.09 
 
 
176 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  27.01 
 
 
180 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  27.27 
 
 
162 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  22.31 
 
 
178 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  29.1 
 
 
181 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  29.6 
 
 
162 aa  49.7  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  22.83 
 
 
178 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  29.27 
 
 
176 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  28.36 
 
 
197 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  28.7 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  28.68 
 
 
162 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  33.63 
 
 
167 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  33.63 
 
 
167 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  24.03 
 
 
173 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  28.46 
 
 
176 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  28.46 
 
 
176 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  29.41 
 
 
168 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  30.97 
 
 
167 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  30.97 
 
 
167 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  31.86 
 
 
167 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  27.62 
 
 
193 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  28.68 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  24.46 
 
 
180 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  27.97 
 
 
179 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  30.97 
 
 
167 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  28.33 
 
 
181 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  32.74 
 
 
167 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  32.74 
 
 
167 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  32.74 
 
 
167 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  30.97 
 
 
167 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0445  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  29.36 
 
 
155 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.29239e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  27.12 
 
 
179 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  36.73 
 
 
711 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  32.29 
 
 
160 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>