232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1152 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  94.04 
 
 		 451 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 453 aa  863    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  62.53 
 
 		 436 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  57.28 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  63.52 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  65.14 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  57.89 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  60.53 
 
 		 461 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.05 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  60.66 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  57.38 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.39 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.36 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.61 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  60.15 
 
 		 437 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.4 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.62 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  58.41 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.87 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.21 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.56 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.85 
 
 		 461 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  54.14 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  51.49 
 
 		 414 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  52.02 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  50.13 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  55.56 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  50.13 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  51.16 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  51.48 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  51.75 
 
 		 539 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  48.47 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  47.13 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  47.25 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  49.74 
 
 		 436 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  42.37 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  45.52 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.5 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  40.71 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.01 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.34 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  38.44 
 
 		 424 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.83 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  50.92 
 
 		 447 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.79 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  40.96 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.97 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.49 
 
 		 391 aa  253  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  41.85 
 
 		 391 aa  253  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.66 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.96 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.59 
 
 		 382 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.9 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  38.3 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  42.61 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.74 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.23 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  41.15 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  38.48 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  39.12 
 
 		 408 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  37.85 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.99 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  35.57 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.99 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.99 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.99 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.89 
 
 		 390 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.03 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  38.26 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.83 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.29 
 
 		 389 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  36.95 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.14 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.67 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.74 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.27 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  42.04 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  41.18 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  40.46 
 
 		 876 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.47 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.44 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  39.5 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.81 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.99 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.31 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.24 
 
 		 394 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.54 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.06 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.98 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.25 
 
 		 398 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  38.46 
 
 		 465 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  38.59 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.23 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.16 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.01 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  42.05 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.76 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.06 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>