79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1997 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  329  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  49.06 
 
 
161 aa  165  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  35.9 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  38.96 
 
 
164 aa  104  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  36.54 
 
 
164 aa  103  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  35.95 
 
 
164 aa  100  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  34.62 
 
 
164 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  35.4 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  31.1 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  28.21 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  28 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  33.63 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  26.58 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  28 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  31.21 
 
 
230 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
297 aa  67.8  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  34.82 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  28.46 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  35.34 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  34.48 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  31.53 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  26.9 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  37.61 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  33.04 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  33.62 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  25.85 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  32.79 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  31 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  30.23 
 
 
141 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  29.17 
 
 
221 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  23.93 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  26.02 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  29.25 
 
 
205 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  26.09 
 
 
159 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  28.72 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  23.01 
 
 
196 aa  54.3  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 
428 aa  53.9  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  25.66 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  23.75 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  24.63 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  27.13 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  22.01 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  24.49 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  29.03 
 
 
489 aa  52.4  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  26.4 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  25.49 
 
 
221 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  25.49 
 
 
221 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  28.86 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  28.07 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  27.74 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  28.83 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  29.41 
 
 
225 aa  48.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  27.88 
 
 
218 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  28.35 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  27.83 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  29.84 
 
 
199 aa  43.9  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  28.23 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  21.82 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  21.32 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  24.73 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  27.42 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  21.32 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  30.7 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  26.89 
 
 
158 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  27.42 
 
 
198 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  28.23 
 
 
199 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>