More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5552 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  100 
 
 		 303 aa  597  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  68.67 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  38.71 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.42 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  34.4 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 327 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  38.87 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  37.55 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.6 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.01 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  32.09 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1837  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  33.88 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2318  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  32.67 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2888  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  33.87 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02580  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  32.67 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>