More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2037 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
472 aa  951    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4589  histidine kinase  53.02 
 
 
493 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6388  histidine kinase  51.28 
 
 
482 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582712  normal  0.0179261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0407  histidine kinase  51.29 
 
 
485 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  52.15 
 
 
487 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2254  histidine kinase  51.51 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5004  cyclic nucleotide-binding protein  49.16 
 
 
486 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1369  cyclic nucleotide-binding protein  48.74 
 
 
483 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.34826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1069  cyclic nucleotide-binding protein  49.27 
 
 
486 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.998398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1085  cyclic nucleotide-binding protein  49.27 
 
 
486 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.0458044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1096  cyclic nucleotide-binding protein  49.06 
 
 
486 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1370  cyclic nucleotide-binding protein  48.63 
 
 
482 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0458  cyclic nucleotide-binding protein  43.25 
 
 
461 aa  308  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0622739  normal  0.251479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2299  histidine kinase  38.51 
 
 
542 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0527  histidine kinase  52.43 
 
 
303 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.157693  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  35.61 
 
 
463 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4575  cyclic nucleotide-binding protein  34.27 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  34.32 
 
 
468 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0368  histidine kinase  31.79 
 
 
466 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99767  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  28.99 
 
 
469 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  36.69 
 
 
472 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.66 
 
 
708 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  36.5 
 
 
468 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
1021 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
1146 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
594 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
971 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  30.89 
 
 
1187 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  37.08 
 
 
439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
1072 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
713 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  31.55 
 
 
646 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
920 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  34.72 
 
 
468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
1036 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  33.64 
 
 
458 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  39.04 
 
 
730 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
571 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
585 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
763 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
468 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  37.57 
 
 
358 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.69 
 
 
726 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.74 
 
 
1901 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
680 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
573 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
571 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  25.54 
 
 
641 aa  123  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  38.12 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  34.5 
 
 
1850 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  38.12 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.5 
 
 
833 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.31 
 
 
1780 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  40.57 
 
 
577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
537 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
928 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
678 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.3 
 
 
1795 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  38.12 
 
 
449 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
641 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
467 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
804 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  37.5 
 
 
406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  35.09 
 
 
505 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  27.05 
 
 
681 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4499  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
674 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278807  normal  0.486911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3068  histidine kinase  38.8 
 
 
485 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.158411  normal  0.556433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
1519 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  36.07 
 
 
310 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
439 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
676 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
699 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
676 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
688 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
676 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
919 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
715 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.75 
 
 
1797 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.01 
 
 
1804 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  34.65 
 
 
524 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
440 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  35.91 
 
 
408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  28.91 
 
 
671 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
685 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  35.91 
 
 
408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
671 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>