164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3070 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  58.45 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  42.67 
 
 		 393 aa  292  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  43.01 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  41.32 
 
 		 393 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  43.58 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  42.74 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  41.8 
 
 		 392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  42.48 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  41.91 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  42.48 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  42.22 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  42.48 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  42.48 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  41.49 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  40.58 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  41.8 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  44.27 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  43.19 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  44 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  42.93 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  42.93 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  42.93 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  42.93 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  42.93 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  42.93 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  44.27 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  43.19 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  42.71 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  42.29 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  41.98 
 
 		 386 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  39.37 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  42.2 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  42.15 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  42.44 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  40.37 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  41.78 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  40.43 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  42.97 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  42.44 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  42.44 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  41.53 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  40.16 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  42.71 
 
 		 391 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  40.43 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  42.18 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  42.71 
 
 		 391 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  38.2 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  38.16 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  39.63 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  37.93 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  37.93 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  42.23 
 
 		 392 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  37.27 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  37.93 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  39.2 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  36.86 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  36.77 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  37.54 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  37.2 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  30.75 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  28.49 
 
 		 395 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.56 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  29.11 
 
 		 398 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  28.92 
 
 		 409 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.55 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.07 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.07 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  30.73 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  26.02 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  26.22 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  25.41 
 
 		 378 aa  99.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  29.38 
 
 		 411 aa  99.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.62 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  24.94 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  27.61 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  28.16 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  26.35 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  28.69 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  26.02 
 
 		 369 aa  86.3  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  27.01 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.07 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  25.48 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  19.9 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.1 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.58 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.37 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  24.37 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  21.59 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  21.53 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  22.92 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  22.67 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.82 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.94 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.32 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  23.06 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  23.81 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>