More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1286 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  38.58 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  37.56 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  37.56 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  37.56 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  37.06 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  37.06 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  35.64 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  34.54 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  33.5 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  33.5 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  32.99 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  35.53 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  35.29 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  34.67 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  35.44 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3411  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.17 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.608689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3065  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.17 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  34.67 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  32.35 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  35.71 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  35.71 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  34 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1526  two-component response regulator EsrB  32.02 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  hitchhiker  0.00169027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1489  EsrB  32.02 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121116  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1950  hypothetical protein  32.02 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1780  EsrB  32.02 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  35.75 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06590  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  31.37 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  33.5 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1504  hypothetical protein  31.53 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000918459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  34.67 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  34.33 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  32.83 
 
 		 455 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 235 aa  99  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  36.08 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>