233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1141 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1141  gluconate transporter  100 
 
 		 421 aa  805    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  unclonable  0.0000000318677 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  78.67 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  78.67 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  78.67 
 
 		 422 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  80.09 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  80.09 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  80.09 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  80.09 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2593  gluconate permease  72.32 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  68.43 
 
 		 424 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  63.86 
 
 		 419 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  63.86 
 
 		 419 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0794  GntP family permease  54.8 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3624  Gluconate transporter  47.2 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1479  H+/gluconate symporter or related permease  43.66 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0621  citrate transporter  43.12 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  27.3 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  24.76 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  24.28 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  26.84 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  25.59 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  26.37 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5300  gluconate transporter  27.23 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  23.9 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  25.59 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  22.8 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  25.59 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  26.93 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0721  gluconate transporter  24.53 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  24.12 
 
 		 447 aa  67  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  28.57 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  28.57 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  28.57 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  28.57 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 498 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  24.76 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0925  gluconate transporter  27.18 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3529  gluconate transporter  25.53 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  24.04 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  31.71 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  23.29 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  23.01 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  23.29 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  23.54 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  27.48 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5115  gluconate transporter family protein  23.5 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  24.94 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2267  gluconate transporter  25.69 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0417  gluconate transporter  23.5 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  22.74 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  24.43 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0785  gluconate transporter  27.29 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.870466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  26.19 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02590  predicted transporter  31.22 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28740  gluconate transporter  25.43 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.152829  normal  0.105113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  22.91 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0948  gluconate transporter  31.22 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.611813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0972  inner membrane permease YgbN  31.22 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.177045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  23.29 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02555  hypothetical protein  31.22 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  27.56 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  22.91 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  26.42 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2878  inner membrane permease YgbN  31.22 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04190  fructuronate transporter  22.58 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3676  gluconate transporter  22.58 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.810405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  28.46 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4848  fructuronate transporter  22.58 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5827  fructuronate transporter  22.58 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.469468  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3882  high-affinity gluconate transporter  22.76 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  24.2 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4919  fructuronate transporter  22.58 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3820  high-affinity gluconate transporter  22.76 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.832032 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4547  fructuronate transporter  22.58 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3134  inner membrane permease YgbN  30.69 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  25.33 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04152  hypothetical protein  22.58 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3786  high-affinity gluconate transporter  22.76 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3714  high-affinity gluconate transporter  22.76 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  23.22 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  24.72 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3037  inner membrane permease YgbN  30.72 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  23.22 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  23.22 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  22.76 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5063  gluconate transporter family protein  32.96 
 
 		 485 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  25.73 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  22.47 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  32.96 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1136  gluconate transporter  26.01 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  24.57 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  23.29 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  23.29 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  23.53 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  27.84 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  22.47 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  20.89 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3711  high-affinity gluconate transporter  22.49 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  22.47 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  23.29 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>