77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1014 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1014  permease  100 
 
 
452 aa  881    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  58.26 
 
 
441 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  57.5 
 
 
431 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  57.08 
 
 
446 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  56.98 
 
 
448 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  56.19 
 
 
442 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  58.76 
 
 
425 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  56.22 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  57.02 
 
 
439 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  55.36 
 
 
439 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  56.79 
 
 
439 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  57.81 
 
 
440 aa  480  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  57.02 
 
 
439 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  57.81 
 
 
439 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  57.59 
 
 
439 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  56.89 
 
 
439 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  56.57 
 
 
439 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  56.57 
 
 
439 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  56.57 
 
 
439 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  56.57 
 
 
439 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  55.75 
 
 
442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  55.23 
 
 
445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  55.78 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  52.01 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  55.78 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  50.11 
 
 
464 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  51.31 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  51.56 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  51.34 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  50.89 
 
 
439 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  50.89 
 
 
439 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  51.34 
 
 
439 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  51.34 
 
 
439 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  51.12 
 
 
439 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  50.89 
 
 
439 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  53.22 
 
 
439 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  51.56 
 
 
439 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  53.22 
 
 
439 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  50.67 
 
 
439 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  49.78 
 
 
439 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  52.46 
 
 
439 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  52.46 
 
 
439 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  46.55 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  52.56 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  52.34 
 
 
441 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  52.12 
 
 
438 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  52.01 
 
 
439 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  46.7 
 
 
438 aa  388  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  46.78 
 
 
438 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  46.78 
 
 
438 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  46.74 
 
 
432 aa  375  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  46.8 
 
 
438 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  46.27 
 
 
435 aa  364  2e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  46.7 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  42.98 
 
 
446 aa  331  1e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  44.79 
 
 
434 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  43.88 
 
 
455 aa  330  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  44.57 
 
 
433 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  44.03 
 
 
433 aa  329  8e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  44.93 
 
 
433 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  43.55 
 
 
455 aa  300  4e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  40.51 
 
 
450 aa  282  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.5 
 
 
571 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  28.5 
 
 
571 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1163  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.92 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.963598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  30.06 
 
 
510 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.59 
 
 
557 aa  50.1  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  23.06 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  23.06 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  23.62 
 
 
470 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  21.36 
 
 
507 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  26.38 
 
 
570 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  24.38 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.29 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  25.31 
 
 
569 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.88 
 
 
567 aa  43.9  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  26.25 
 
 
521 aa  43.5  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>