More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3762 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  100 
 
 
202 aa  405  1e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.62752e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  70 
 
 
205 aa  273  1e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  70 
 
 
205 aa  273  2e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  7.95599e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  67.51 
 
 
201 aa  271  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  69.5 
 
 
205 aa  271  4e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  69.5 
 
 
205 aa  270  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  4.93749e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  68.5 
 
 
205 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.75672e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  68.5 
 
 
205 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  68 
 
 
205 aa  267  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.65015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  68 
 
 
205 aa  267  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.6206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  69 
 
 
205 aa  264  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  65.64 
 
 
205 aa  257  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  8.85834e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  65.69 
 
 
219 aa  255  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.16241e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  60.4 
 
 
201 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  59.71 
 
 
218 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.24061e-08  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  61.19 
 
 
211 aa  238  6e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  40.28 
 
 
212 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_002567  Pilin protein  42.44 
 
 
195 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  36.82 
 
 
229 aa  108  4e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  48.89 
 
 
163 aa  84  1e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2826  MSHA pilin protein MshB  40 
 
 
184 aa  79.3  4e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  40.54 
 
 
195 aa  77  2e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  36.13 
 
 
197 aa  76.3  3e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  33.59 
 
 
187 aa  76.3  3e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  34.13 
 
 
187 aa  75.9  4e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  34.13 
 
 
187 aa  75.9  4e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  34.13 
 
 
187 aa  75.9  4e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0475  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHB)  41.03 
 
 
189 aa  74.3  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  41.67 
 
 
157 aa  74.3  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  41.75 
 
 
156 aa  74.3  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  31.64 
 
 
178 aa  73.2  3e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  72.8  4e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  31.43 
 
 
185 aa  72  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  28.57 
 
 
186 aa  72  5e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  29.32 
 
 
193 aa  71.2  9e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  32.2 
 
 
180 aa  71.2  9e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  40.4 
 
 
168 aa  70.9  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  38.58 
 
 
173 aa  70.9  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  43.82 
 
 
169 aa  70.5  2e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  42.68 
 
 
163 aa  70.1  2e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  70.5  2e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.39 
 
 
156 aa  69.7  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  37.74 
 
 
163 aa  68.9  4e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  52.24 
 
 
187 aa  68.9  4e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  37.27 
 
 
182 aa  69.3  4e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  42.11 
 
 
165 aa  68.9  4e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  41.35 
 
 
178 aa  69.3  4e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  46.15 
 
 
176 aa  68.6  6e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.43336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  44.57 
 
 
172 aa  68.6  7e-11  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.27612e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  43.24 
 
 
166 aa  68.2  9e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  38.3 
 
 
166 aa  67.4  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  28.65 
 
 
186 aa  67.4  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  29.5 
 
 
185 aa  67.4  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  37.19 
 
 
192 aa  67  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  31.09 
 
 
193 aa  67  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  42.22 
 
 
168 aa  66.6  2e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  33.56 
 
 
193 aa  66.2  3e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  36.97 
 
 
191 aa  66.6  3e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  35.83 
 
 
170 aa  65.9  4e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  41.86 
 
 
146 aa  65.9  4e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  47.62 
 
 
175 aa  65.5  5e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.46782e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  32.93 
 
 
201 aa  65.1  7e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  35 
 
 
191 aa  64.7  9e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  33.94 
 
 
201 aa  64.3  1e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  43.84 
 
 
174 aa  64.3  1e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  5.13166e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  33.61 
 
 
192 aa  64.3  1e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  34.56 
 
 
186 aa  64.3  1e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.97616e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  45.61 
 
 
187 aa  63.9  2e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  42.47 
 
 
169 aa  63.5  2e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.94883e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  42.47 
 
 
169 aa  63.5  2e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  46.27 
 
 
169 aa  63.2  3e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0759  hypothetical protein  35.97 
 
 
165 aa  63.2  3e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0153764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  33.93 
 
 
108 aa  63.2  3e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70582e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  34.17 
 
 
191 aa  63.2  3e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  42.65 
 
 
171 aa  63.2  3e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  40.74 
 
 
182 aa  62.8  4e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  62.22 
 
 
139 aa  62.4  4e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  48.21 
 
 
182 aa  62.4  5e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  40.51 
 
 
163 aa  61.6  7e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  45.83 
 
 
169 aa  61.6  8e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  34.71 
 
 
126 aa  61.2  9e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  29.83 
 
 
172 aa  61.2  9e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.12537e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  39.78 
 
 
173 aa  61.6  9e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  60.8  1e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  32.77 
 
 
177 aa  60.8  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  60.8  1e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  45.83 
 
 
169 aa  61.2  1e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.41512e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  60.5  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  39.36 
 
 
172 aa  60.1  2e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  60.5  2e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  48.28 
 
 
178 aa  60.1  2e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.02365e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.56 
 
 
163 aa  60.5  2e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  38.54 
 
 
173 aa  60.1  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.58454e-05  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  43.08 
 
 
190 aa  59.7  3e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  59.7  3e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  37.35 
 
 
159 aa  58.9  4e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  40.24 
 
 
172 aa  58.5  6e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  31.76 
 
 
173 aa  58.5  6e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  59.09 
 
 
138 aa  58.2  8e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.58855e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  33.98 
 
 
179 aa  58.2  8e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>