71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0099 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  463  1e-130  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  65.77 
 
 
222 aa  310  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  63.64 
 
 
220 aa  298  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  62.78 
 
 
232 aa  290  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  61.5 
 
 
212 aa  268  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  61.97 
 
 
212 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  4.96851e-12 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  61.5 
 
 
212 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  61.03 
 
 
212 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.31362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  61.03 
 
 
212 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  61.03 
 
 
212 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  60.56 
 
 
212 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  60.09 
 
 
212 aa  259  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  62.44 
 
 
212 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  52.7 
 
 
226 aa  238  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.69669e-05  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  54.34 
 
 
220 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  48.4 
 
 
223 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  36.15 
 
 
214 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  35.85 
 
 
215 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  35.24 
 
 
222 aa  140  2e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
212 aa  140  2e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  35.85 
 
 
233 aa  139  4e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  33.65 
 
 
212 aa  134  2e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  33.81 
 
 
212 aa  130  1e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  34.6 
 
 
217 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  31.88 
 
 
257 aa  120  2e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  31.13 
 
 
230 aa  120  2e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  33.02 
 
 
215 aa  120  2e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  34.76 
 
 
225 aa  120  2e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  34.42 
 
 
212 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  34.12 
 
 
213 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
216 aa  114  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
223 aa  110  1e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  30 
 
 
223 aa  110  2e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  31.34 
 
 
215 aa  110  2e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
211 aa  109  4e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  33.18 
 
 
212 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  32.55 
 
 
212 aa  108  9e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
212 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  30.14 
 
 
222 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
214 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
212 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
217 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.84 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
211 aa  95.5  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 
217 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  28.17 
 
 
211 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  28.11 
 
 
211 aa  84  2e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  27.36 
 
 
213 aa  79  6e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  29.08 
 
 
214 aa  72.4  5e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 
333 aa  57.4  2e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  24.36 
 
 
286 aa  57  2e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 
323 aa  53.9  2e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
323 aa  53.9  2e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  22.17 
 
 
214 aa  52  8e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  26.34 
 
 
304 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  30 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  30 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  20.09 
 
 
346 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  28.33 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.19 
 
 
345 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.75 
 
 
336 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.43 
 
 
329 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.29 
 
 
274 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.71 
 
 
672 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  22.95 
 
 
457 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.85 
 
 
239 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  28 
 
 
271 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1094 aa  41.6  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>