More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5939 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 218 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  78.44 
 
 		 218 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.51 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.89 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.66 
 
 		 217 aa  296  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  65.44 
 
 		 219 aa  284  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.67 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  66.36 
 
 		 217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  65.12 
 
 		 215 aa  278  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  64.52 
 
 		 217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.67 
 
 		 217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.21 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.55 
 
 		 218 aa  257  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  61.93 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  58.72 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  61.4 
 
 		 217 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 222 aa  237  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  56.68 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 227 aa  234  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.68 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.76 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  58.99 
 
 		 231 aa  224  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 222 aa  224  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.14 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  53.05 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.76 
 
 		 227 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.38 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.88 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.07 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.46 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.84 
 
 		 234 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  45.45 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  41.55 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  42.01 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  45.91 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  39.37 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  41.89 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 227 aa  154  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  41.89 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.2 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  42.01 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  41.89 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  40.18 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  41.28 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>