More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0794 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  64.66 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  54.94 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 		 249 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 646 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  56.83 
 
 		 240 aa  255  6e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  50.4 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 252 aa  251  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.9 
 
 		 655 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.39 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  48.19 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  48.99 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  53.19 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 650 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  235  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 254 aa  234  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  49.38 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  48.76 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.11 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 298 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  47.24 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  47.26 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.72 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.53 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>