173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1724 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  68.29 
 
 		 819 aa  1177    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  100 
 
 		 824 aa  1701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  68.13 
 
 		 819 aa  1182    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  67.61 
 
 		 815 aa  1186    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  40.78 
 
 		 802 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  39.87 
 
 		 802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.03 
 
 		 845 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.5 
 
 		 845 aa  514  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  34.97 
 
 		 864 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.41 
 
 		 842 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  35.07 
 
 		 875 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  34.07 
 
 		 860 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 891 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  33.29 
 
 		 891 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 871 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  31.93 
 
 		 813 aa  419  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 		 863 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  32.48 
 
 		 861 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 		 897 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  34.14 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.91 
 
 		 813 aa  386  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.23 
 
 		 872 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 785 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 		 793 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.39 
 
 		 835 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  32.63 
 
 		 824 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  31.94 
 
 		 819 aa  352  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  33.5 
 
 		 812 aa  352  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  34.78 
 
 		 823 aa  351  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  34.32 
 
 		 840 aa  349  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  33.06 
 
 		 839 aa  345  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  34.33 
 
 		 829 aa  344  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.58 
 
 		 843 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  36.73 
 
 		 799 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  32.02 
 
 		 833 aa  338  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  31.24 
 
 		 880 aa  335  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  28.43 
 
 		 837 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.96 
 
 		 843 aa  330  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  33.12 
 
 		 846 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  27.46 
 
 		 847 aa  325  3e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  31.46 
 
 		 831 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.93 
 
 		 818 aa  322  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  32.86 
 
 		 838 aa  317  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.29 
 
 		 817 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  28.32 
 
 		 837 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.04 
 
 		 940 aa  314  3.9999999999999997e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  39.3 
 
 		 663 aa  241  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  25 
 
 		 845 aa  205  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.72 
 
 		 826 aa  177  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 816 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.79 
 
 		 826 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  26.48 
 
 		 821 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  26.59 
 
 		 820 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  28.13 
 
 		 839 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 853 aa  155  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  27.41 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  27.41 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  27.41 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  27.41 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  27.41 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  27.41 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  26.73 
 
 		 839 aa  152  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  29.87 
 
 		 827 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  29.94 
 
 		 812 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  28.96 
 
 		 828 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  28.96 
 
 		 828 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  28.96 
 
 		 828 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  29.15 
 
 		 816 aa  147  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.4 
 
 		 744 aa  146  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  26.59 
 
 		 856 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 		 763 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  29 
 
 		 825 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  25.15 
 
 		 811 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.38 
 
 		 882 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  28.6 
 
 		 882 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  24.55 
 
 		 962 aa  121  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.8 
 
 		 878 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.88 
 
 		 815 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 1144 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.7 
 
 		 734 aa  106  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.03 
 
 		 1362 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.12 
 
 		 984 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.29 
 
 		 720 aa  95.5  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.66 
 
 		 971 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 724 aa  94.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 739 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.49 
 
 		 906 aa  77.4  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  25.44 
 
 		 1270 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.85 
 
 		 992 aa  76.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.4 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.72 
 
 		 884 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  25.14 
 
 		 613 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.03 
 
 		 609 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.04 
 
 		 1033 aa  61.6  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  24.22 
 
 		 972 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.95 
 
 		 992 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 873 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.95 
 
 		 858 aa  58.9  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 1063 aa  57.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  33.54 
 
 		 1003 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>