77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3589 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3589  Fimbrial protein pilin  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04051  fimbrial protein  51.64 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  55.36 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  31.82 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  32.33 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  27.74 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  27.97 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  30.43 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  32.84 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  31.39 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.94 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  29.41 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  29.29 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  27.81 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  29.05 
 
 		 179 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  35.16 
 
 		 409 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  42.11 
 
 		 424 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  27.81 
 
 		 168 aa  52.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  33.12 
 
 		 165 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  30.88 
 
 		 136 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  31.39 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  28.36 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  47.06 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  30.83 
 
 		 136 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  46 
 
 		 169 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3371  Zinc finger-domain-containing protein  39.66 
 
 		 571 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  29.23 
 
 		 136 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  30.08 
 
 		 727 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  31.69 
 
 		 160 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  32.48 
 
 		 141 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  30.08 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  28.36 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  30.66 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.33 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  34.15 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  32.39 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  35.88 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  32.31 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  23.66 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  28.66 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  41.67 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  28.66 
 
 		 169 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  45.61 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  29.01 
 
 		 139 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.61 
 
 		 167 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  31.37 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  40.82 
 
 		 363 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  28.83 
 
 		 133 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  67.86 
 
 		 179 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3995  hypothetical protein  32.63 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00690793  normal  0.10342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  28.46 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  33.67 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  71.43 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  30.41 
 
 		 438 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  24.62 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  30.41 
 
 		 446 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.75 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1033  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  64.29 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  34.34 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0077  hypothetical protein  41.86 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  25.37 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  25.37 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  25.37 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  37.7 
 
 		 148 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  26.92 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  43.18 
 
 		 167 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  30.77 
 
 		 605 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40 
 
 		 173 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.35 
 
 		 169 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  40.35 
 
 		 129 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.71 
 
 		 173 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  52.5 
 
 		 165 aa  42.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.82 
 
 		 174 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42 
 
 		 161 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 179 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  34 
 
 		 138 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>