33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3995 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3995  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00690793  normal  0.10342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3543  hypothetical protein  31.94 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0158  hypothetical protein  28.48 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4655  hypothetical protein  29.61 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5084  hypothetical protein  27.15 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5086  hypothetical protein  28.95 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  44.62 
 
 
727 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4762  hypothetical protein  29.53 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5082  hypothetical protein  29.49 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5052  hypothetical protein  28.29 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5178  hypothetical protein  28.29 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4813  hypothetical protein  28.29 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.269891  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3203  hypothetical protein  33.56 
 
 
167 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000632331  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1264  hypothetical protein  25.71 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0052  hypothetical protein  30.41 
 
 
171 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0018  hypothetical protein  30.41 
 
 
171 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0037  hypothetical protein  32.88 
 
 
171 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2141  group-specific protein  26.09 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2108  hypothetical protein  25.47 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.251468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.15 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2040  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2072  hypothetical protein  25.47 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1893  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.897359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1855  hypothetical protein  25.43 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3279  group-specific protein  26.04 
 
 
328 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  36.67 
 
 
409 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 
422 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1890  hypothetical protein  26.67 
 
 
332 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0252667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2030  hypothetical protein  26.67 
 
 
334 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1845  group-specific protein  24.52 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  29.58 
 
 
576 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3589  Fimbrial protein pilin  32.84 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  40.82 
 
 
424 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>