50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04051 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04051  fimbrial protein  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3589  Fimbrial protein pilin  42.8 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  28.75 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  28.06 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  25.37 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  26.76 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  25.19 
 
 		 139 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  25.66 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  27.22 
 
 		 162 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  25.37 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  24.82 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  35.71 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  27.34 
 
 		 136 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  27.34 
 
 		 136 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  26.62 
 
 		 136 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  34.85 
 
 		 169 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  39.62 
 
 		 169 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  25.19 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  37.5 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  26.47 
 
 		 136 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  36.84 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  35.59 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  23.91 
 
 		 136 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  39.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.73 
 
 		 142 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  39.13 
 
 		 141 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  28.45 
 
 		 139 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  26.75 
 
 		 165 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.27 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.48 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  37.29 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  38.3 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  22.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  30.12 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  30.38 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  31 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  30.38 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  30.12 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  38 
 
 		 167 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  25 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  30.12 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  30.99 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  27.4 
 
 		 173 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  31.25 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  31.37 
 
 		 142 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  28.03 
 
 		 149 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  28.4 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>