More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0466 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 480 aa  965    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.61 
 
 		 486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.82 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  50.75 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5620  GntR family transcriptional regulator  59.89 
 
 		 378 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1936  GntR family transcriptional regulator  45.84 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.14 
 
 		 480 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.14 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 532 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  38.43 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.02 
 
 		 475 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.69 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  37.42 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 472 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 472 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 472 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  37.76 
 
 		 493 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 472 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 472 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.86 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 487 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 483 aa  294  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 492 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 474 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.97 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.38 
 
 		 487 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 		 471 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 474 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 474 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  37.87 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.08 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 494 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 504 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  37.16 
 
 		 504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 469 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 469 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 473 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 473 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 477 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 469 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  37.87 
 
 		 479 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  35.68 
 
 		 479 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 479 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.91 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.38 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.7 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 475 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 477 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 494 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 473 aa  280  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 477 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 477 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 479 aa  279  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 477 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 497 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 480 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.37 
 
 		 487 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  36.38 
 
 		 480 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  33.26 
 
 		 471 aa  276  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 509 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>